上手体验
如果你手头还没有合适的 VCF 用于测试,我们准备了 4 份模拟数据,方便你上手体验 Noxia。
这些数据均基于一例公开样本 NA12878 构建:
- NA12878(阴性对照) —— 已移除 gnomAD 人群频率 > 10% 的常见变异。
- 3 个阳性案例 —— 临床描述来自《中国循证儿科杂志》发表的真实病例;我们将各案例已报告的阳性变异插入到上述 NA12878 的 VCF 中,构成可供分析的阳性样本。
下载后即可在 Claude Code 中让 Noxia 分析。建议先尝试阴性对照,再挑战 3 个阳性案例。
阴性对照
NA12878
已移除人群频率 > 10% 的常见变异,可用于校准与对照。
阳性案例
案例一:KIF11 基因变异(MCLMR 综合征)
患儿男,7 岁。匀称性身材矮小、小头畸形、面容异常(前额略饱满、眼睑下垂并下斜、招风耳),运动发育大致正常但认知发育滞后;眼底检查提示脉络膜与视网膜发育不良。
家系全外显子组测序显示患儿携带 KIF11(NM_004523.3:c.1306-1G>A)变异,父母及兄长均未携带,符合常染色体显性遗传。依据 ACMG 指南判定为致病变异(PVS1 + PS2_Moderate + PM2)。诊断为小头畸形伴或不伴视网膜病变、淋巴水肿或智力障碍综合征(MCLMR,OMIM 152950)。
马春苗,陈军辉,刘俊枫,等. 小头畸形伴或不伴视网膜色素变性、淋巴水肿或智力障碍综合征相关 KIF11 基因变异 1 例病例报告并文献复习[J]. 中国循证儿科杂志, 2026, 21(2): 155-158.
案例二:SPTAN1 基因变异(遗传性痉挛性截瘫 91 型)
患儿男,8 岁。运动里程碑基本正常,但自幼行走前倾、易跌倒,呈典型摇摆步态;查体见下肢肌力下降、双侧肱二三头肌腱及膝跟腱反射亢进、四肢浅感觉稍减退;肌电图提示以脱髓鞘为主的多发性周围神经病电生理表现。
基因检测显示患儿携带 SPTAN1(NM_001130438.3:c.77_103dup,p.T34_L35insHHRFKELST)杂合变异,家系验证为新发突变(父母均为野生型)。依据 ACMG 指南判定为可能致病变异(PS2 + PM2_Supporting + PM4)。
朱子豪,华冉,王宝田,等. SPTAN1 基因变异致遗传性痉挛性截瘫 91 型 1 例病例报告并文献复习[J]. 中国循证儿科杂志, 2026, 21(1): 76-80. DOI: 10.3969/j.issn.1673-5501.2026.01.011
案例三:NONO 基因变异(MRXS34 综合征)
患儿男,5 日龄,因「呼吸困难伴腹胀」转入 NICU。系孕 34⁺³ 周早产儿,查体见前额宽、小眼裂、鼻梁塌陷、耳廓形态畸形、双手通贯掌、右手多指畸形、双侧隐睾、肌张力稍低。
基因检测显示患儿 Xq13.1 区 NONO(NM_001145408.2:c.1093C>T,p.R365*)杂合变异,位于第 10 号外显子,来源于母亲,符合 X 连锁隐性遗传。依据 ACMG 指南判定为致病变异。确诊为 X 连锁智力发育迟缓综合征 34 型(MRXS34)。
章紫晨,朱元元,陈鸣艳,等. NONO 基因突变致新生儿 MRXS34 综合征 1 例病例报告并文献复习. 浙江大学医学院附属儿童医院.